Тест с ответами по теме «Методы геномного редактирования»

Тест с ответами по теме

«Методы геномного редактирования»

Правильные ответы выделены синим цветом (ответов может быть несколько)

1. CRISPR в прокариотической клетке выполняет функцию

1) противовирусной защиты
2) репликации ДНК
3) устойчивости к антибиотикам
4) устойчивости к факторам окружающей среды

2. CRISPR расшифровывается как

1) длинные последовательности ДНК
2) короткие палиндромные повторы, регулярно расположенные группами
3) минисателлиты, состоящие преимущественно из ГЦ-повторов
4) ретротранспозоны

3. Cas9 является

1) белком
2) жиром
3) нуклеиновой кислотой
4) углеводом

4. Белки семейства Cas в природе встречаются у

1) бактерий
2) вирусов
3) грибов
4) эукариот

5. Биологической функцией системы CRISPR-Cas9 является

1) защита прокариотической клетки от вирусов путем расщепления нуклеиновых кислот
2) расщепление бактериальной геномной ДНК по кодируемым в CRISPR кассете последовательностям в процессе деления клетки
3) расщепление плазмидной ДНК для встраивания кодируемых ими полезных для бактерии признаков в собственный геном
4) фрагментация ДНК эукариотической клетки в специфическом локусе для встраивания генома аденоассоциированных вирусов

6. В основе метода CRISPR-Cas9 лежит фермент

1) лигаза
2) люцифераза
3) нуклеаза
4) топоизомераза

7. Геномное редактирование осуществляют с помощью

1) антибиотиков
2) кислот
3) систем CRISPR-Cas9, ZFNs, TALENs
4) солей

8. ДНК-связывающий локус нуклеазы TALE распознает

1) двуцепочечный разрыв ДНК
2) мутацию в ДНК
3) одиночные нуклеотиды в ДНК
4) триплеты ДНК

9. ДНК-связывающий локус нуклеазы цинковых пальцев распознает

1) двуцепочечный разрыв ДНК
2) мутацию в ДНК
3) одиночные нуклеотиды в ДНК
4) триплеты ДНК

10. Для доставки нуклеиновых кислот в клетки не может быть использован

1) аденоассоциированный вирус
2) аденовирус
3) вирус Эпштейна-Барр
4) лентивирус

11. Инделы в последовательности ДНК образуются в случае

1) лигированияолигонуклеотидов
2) направленной гомологичной репарации ДНК
3) репарации ДНК путем негомологичного соединения концов
4) хромосомных перестроек

12. К методу геномного редактирования относят

1) CRISPR-Cas9
2) NGS
3) ПДРФ
4) ПЦР

13. К основным модификациям метода CRISPR-Cas9 относят

1) митохондриальные редакторы
2) праймированное редактирование
3) редакторы анеуплоидий
4) редакторы оснований

14. Комплекс MRN участвует в

1) направленной гомологичной репарации
2) негомологичном соединении концов
3) эксцизионной репарации нуклеотидов
4) эксцизионной репарации оснований

15. Лентивирусные векторы отличаются

1) высокой пакующей емкостью
2) инсерционным мутагенезом
3) транзиторной экспрессией
4) тропизмом к определенным клеткам

16. Наиболее эффективной стратегией лечения миодистрофииДюшенна с помощью методов геномного редактирования является

1) активация транскрипции гена DMD
2) встраивание полной кодирующей последовательности гена DMD
3) ингибирование транскрипции гена DMD
4) пропуск одного или нескольких экзонов гена DMD с восстановлением рамки считывания

17. Направленная гомологичная репарация у высших эукариотов активна в фазе клеточного цикла

1) G0 фазе
2) S и ранней G2 фазах
3) М и ранней G1 фазах
4) М фазе

18. Направляющая РНК используется в методе геномного редактирования

1) CRISPR-Cas9
2) мегануклеазы
3) нуклеазы TALE
4) нуклеазы цинковых пальцев

19. Нуклеаза FokI используется в методах геномного редактирования

1) CRISPR-Cas9
2) мегануклеазы
3) нуклеазы TALE
4) нуклеазы цинковых пальцев

20. Одной из отличительных особенностей направленной гомологичной репарации является

1) внесение короткихинсерций или делеций в локус разрыва при репарации
2) внесение протяженныхделеций (1-2kb) в локус разрыва при репарации
3) высокая эффективность в течение всего клеточного цикла
4) необходимость наличия донорной матрицы для рекомбинации

21. Определенная мутация в гене ССR5 делает человека невосприимчивым к

1) бледной трепонеме
2) вирусу гепатита С
3) вирусу гриппа
4) вирусу иммунодефицита человека

22. Основной проблемой использования CRISPR-Cas9 в эукариотических клетках является

1) индукция апоптоза
2) неспецифическое связывание с последовательностью ДНК
3) осмотический шок
4) токсичность чужеродного агента

23. Основоположниками метода CRISPR-Cas9 для изменения генома эукариотической клетки являются

1) Джеймс Уотсон
2) Дженнифер Дудна
3) СинъяЯманака
4) Фрэнсис Крик
5) Эммануэль Шарпантье

24. Отличительной особенностью модификации «праймированное редактирование» является использование белка

1) KU70
2) дезаминазы
3) лигазы
4) обратной транскриптазы

25. Перечень моногенных заболеваний, для которых проводят клинические исследования по разработке методов лечения с помощью геномного редактирования включает

1) муковисцидоз
2) серповидно-клеточную анемию
3) синдром Ангельмана
4) синдром Дауна

26. Под действием нуклеазы происходит

1) двуцепочечный разрыв ДНК
2) замена одного нуклеотида на другой
3) образование активных форм кислорода
4) образование пиримидиновогодимера

27. Под инделом понимают

1) вставку или делецию нескольких нуклеотидов
2) метилирование ДНК
3) однонуклеотидную замену в ДНК
4) хромосомную транслокацию

28. Под неспецифической (офф-таргетной) активностью геномного редактирования понимают

1) внесение дополнительных мутаций в таргетный локус
2) вставку нескольких нуклеотидов в таргетный локус
3) замену одного нуклеотида на другой в таргетном локусе
4) создание двуцепочечного разрыва ДНК вне таргетного локуса

29. Под нокаутом гена зачастую понимают

1) временное снижение экспрессии гена
2) временную активацию гена
3) метилирование гена
4) нарушение последовательности гена с образованием преждевременного стоп-кодона

30. Под редактированием оснований понимают метод геномного редактирования, позволяющий

1) внести индел в последовательность ДНК
2) внести однонуклеотидную замену в ДНК
3) интегрировать фрагмент гена
4) удалить экзон из ДНК

31. Преобладающим типом репарации ДНК после внесения CRISPR-Cas9 разрыва является

1) направленная гомологичная репарация
2) негомологичное соединение концов
3) однонитевой отжиг (SSA-single-strandannealing)
4) эксцизионная репарация

32. При муковисцидозе нужно редактировать ген

1) CFTR
2) DES
3) DMD
4) SRY

33. Редакторы оснований могут конвертировать следующие нуклеотиды

1) аденин в гуанин
2) гуанин в цитозин
3) тимин в гуанин
4) цитозин в тимин

34. Рекомбинантные аденоассоциированные вирусные векторы отличаются

1) высокой пакующей емкостью
2) инсерционным мутагенезом
3) низкой иммуногенностью
4) тропизмом к определенным клеткам

35. С использованием методов геномного редактирования в настоящее время могут быть устранены причины

1) заболеваний, вызванные хромосомными перестройками
2) заболеваний, вызванных геномными мутациями
3) моногенных наследственных заболеваний
4) полигенных наследственных заболеваний

36. С помощью геномного редактирования можно

1) изменить Ph клетки
2) изменить последовательность генома клетки
3) приобрести устойчивость к новым мутациям
4) увеличить уровень IQ человека

37. С помощью системы CRISPR-Сas9 нельзя

1) исправить анеуплоидию
2) исправить индел
3) исправить точечную мутацию
4) сделать нокаут гена

38. Свойством фермента с нуклеазной активностью является

1) вставка нескольких нуклеотидов
2) замена одного нуклеотида на другой
3) создание двуцепочечного разрыва ДНК
4) создание одноцепочечного разрыва ДНК

39. Система CRISPR-Cas9 основана на

1) ДНК бактериофагов
2) иммунной системе бактерий
3) особых ферментах человека
4) плазмидах архей

40. Система CRISPR-Cas9 является защитной системой у

1) бактерий
2) вирусов
3) моллюсков
4) членистоногих

41. Система CRISPR-Сas9 была

1) открыта в клетках человека
2) открыта у бактерий
3) разработана биологами-синтетиками
4) разработана биофизиками

42. Системой CRISPR-Cas9 могут быть отредактированы

1) белки
2) жиры
3) низкомолекулярные вещества
4) последовательности ДНК

43. Теоретически методом редактирования генома можно вылечить

1) ОРВИ
2) инфекционное отравление
3) муковисцидоз
4) солнечный удар

44. У бактерий система CRISPR-Cas9 уничтожает вирус путем

1) лизирования ДНК вируса ферментами
2) растворения ДНК вируса в особой кислоте
3) упаковки вируса в особую белковую оболочку, откуда он не может выйти и умирает
4) фрагментации ДНК вируса

45. Ферментом, сшивающим две цепи ДНК при разрыве, является

1) лигаза
2) метилтрансфераза
3) полимераза
4) эндонуклеаза