Тест с ответами по теме
«Методы геномного редактирования»
Правильные ответы выделены синим цветом (ответов может быть несколько)
- CRISPR в прокариотической клетке выполняет функцию
1) противовирусной защиты
2) репликации ДНК
3) устойчивости к антибиотикам
4) устойчивости к факторам окружающей среды
- CRISPR расшифровывается как
1) длинные последовательности ДНК
2) короткие палиндромные повторы, регулярно расположенные группами
3) минисателлиты, состоящие преимущественно из ГЦ-повторов
4) ретротранспозоны
- Cas9 является
1) белком
2) жиром
3) нуклеиновой кислотой
4) углеводом
- Белки семейства Cas в природе встречаются у
1) бактерий
2) вирусов
3) грибов
4) эукариот
- Биологической функцией системы CRISPR-Cas9 является
1) защита прокариотической клетки от вирусов путем расщепления нуклеиновых кислот
2) расщепление бактериальной геномной ДНК по кодируемым в CRISPR кассете последовательностям в процессе деления клетки
3) расщепление плазмидной ДНК для встраивания кодируемых ими полезных для бактерии признаков в собственный геном
4) фрагментация ДНК эукариотической клетки в специфическом локусе для встраивания генома аденоассоциированных вирусов
- В основе метода CRISPR-Cas9 лежит фермент
1) лигаза
2) люцифераза
3) нуклеаза
4) топоизомераза
- Геномное редактирование осуществляют с помощью
1) антибиотиков
2) кислот
3) систем CRISPR-Cas9, ZFNs, TALENs
4) солей
- ДНК-связывающий локус нуклеазы TALE распознает
1) двуцепочечный разрыв ДНК
2) мутацию в ДНК
3) одиночные нуклеотиды в ДНК
4) триплеты ДНК
- ДНК-связывающий локус нуклеазы цинковых пальцев распознает
1) двуцепочечный разрыв ДНК
2) мутацию в ДНК
3) одиночные нуклеотиды в ДНК
4) триплеты ДНК
- Для доставки нуклеиновых кислот в клетки не может быть использован
1) аденоассоциированный вирус
2) аденовирус
3) вирус Эпштейна-Барр
4) лентивирус
- Инделы в последовательности ДНК образуются в случае
1) лигированияолигонуклеотидов
2) направленной гомологичной репарации ДНК
3) репарации ДНК путем негомологичного соединения концов
4) хромосомных перестроек
- К методу геномного редактирования относят
1) CRISPR-Cas9
2) NGS
3) ПДРФ
4) ПЦР
- К основным модификациям метода CRISPR-Cas9 относят
1) митохондриальные редакторы
2) праймированное редактирование
3) редакторы анеуплоидий
4) редакторы оснований
- Комплекс MRN участвует в
1) направленной гомологичной репарации
2) негомологичном соединении концов
3) эксцизионной репарации нуклеотидов
4) эксцизионной репарации оснований
- Лентивирусные векторы отличаются
1) высокой пакующей емкостью
2) инсерционным мутагенезом
3) транзиторной экспрессией
4) тропизмом к определенным клеткам
- Наиболее эффективной стратегией лечения миодистрофииДюшенна с помощью методов геномного редактирования является
1) активация транскрипции гена DMD
2) встраивание полной кодирующей последовательности гена DMD
3) ингибирование транскрипции гена DMD
4) пропуск одного или нескольких экзонов гена DMD с восстановлением рамки считывания
- Направленная гомологичная репарация у высших эукариотов активна в фазе клеточного цикла
1) G0 фазе
2) S и ранней G2 фазах
3) М и ранней G1 фазах
4) М фазе
- Направляющая РНК используется в методе геномного редактирования
1) CRISPR-Cas9
2) мегануклеазы
3) нуклеазы TALE
4) нуклеазы цинковых пальцев
- Нуклеаза FokI используется в методах геномного редактирования
1) CRISPR-Cas9
2) мегануклеазы
3) нуклеазы TALE
4) нуклеазы цинковых пальцев
- Одной из отличительных особенностей направленной гомологичной репарации является
1) внесение короткихинсерций или делеций в локус разрыва при репарации
2) внесение протяженныхделеций (1-2kb) в локус разрыва при репарации
3) высокая эффективность в течение всего клеточного цикла
4) необходимость наличия донорной матрицы для рекомбинации
- Определенная мутация в гене ССR5 делает человека невосприимчивым к
1) бледной трепонеме
2) вирусу гепатита С
3) вирусу гриппа
4) вирусу иммунодефицита человека
- Основной проблемой использования CRISPR-Cas9 в эукариотических клетках является
1) индукция апоптоза
2) неспецифическое связывание с последовательностью ДНК
3) осмотический шок
4) токсичность чужеродного агента
- Основоположниками метода CRISPR-Cas9 для изменения генома эукариотической клетки являются
1) Джеймс Уотсон
2) Дженнифер Дудна
3) СинъяЯманака
4) Фрэнсис Крик
5) Эммануэль Шарпантье
- Отличительной особенностью модификации «праймированное редактирование» является использование белка
1) KU70
2) дезаминазы
3) лигазы
4) обратной транскриптазы
- Перечень моногенных заболеваний, для которых проводят клинические исследования по разработке методов лечения с помощью геномного редактирования включает
1) муковисцидоз
2) серповидно-клеточную анемию
3) синдром Ангельмана
4) синдром Дауна
- Под действием нуклеазы происходит
1) двуцепочечный разрыв ДНК
2) замена одного нуклеотида на другой
3) образование активных форм кислорода
4) образование пиримидиновогодимера
- Под инделом понимают
1) вставку или делецию нескольких нуклеотидов
2) метилирование ДНК
3) однонуклеотидную замену в ДНК
4) хромосомную транслокацию
- Под неспецифической (офф-таргетной) активностью геномного редактирования понимают
1) внесение дополнительных мутаций в таргетный локус
2) вставку нескольких нуклеотидов в таргетный локус
3) замену одного нуклеотида на другой в таргетном локусе
4) создание двуцепочечного разрыва ДНК вне таргетного локуса
- Под нокаутом гена зачастую понимают
1) временное снижение экспрессии гена
2) временную активацию гена
3) метилирование гена
4) нарушение последовательности гена с образованием преждевременного стоп-кодона
- Под редактированием оснований понимают метод геномного редактирования, позволяющий
1) внести индел в последовательность ДНК
2) внести однонуклеотидную замену в ДНК
3) интегрировать фрагмент гена
4) удалить экзон из ДНК
- Преобладающим типом репарации ДНК после внесения CRISPR-Cas9 разрыва является
1) направленная гомологичная репарация
2) негомологичное соединение концов
3) однонитевой отжиг (SSA-single-strandannealing)
4) эксцизионная репарация
- При муковисцидозе нужно редактировать ген
1) CFTR
2) DES
3) DMD
4) SRY
- Редакторы оснований могут конвертировать следующие нуклеотиды
1) аденин в гуанин
2) гуанин в цитозин
3) тимин в гуанин
4) цитозин в тимин
- Рекомбинантные аденоассоциированные вирусные векторы отличаются
1) высокой пакующей емкостью
2) инсерционным мутагенезом
3) низкой иммуногенностью
4) тропизмом к определенным клеткам
- С использованием методов геномного редактирования в настоящее время могут быть устранены причины
1) заболеваний, вызванные хромосомными перестройками
2) заболеваний, вызванных геномными мутациями
3) моногенных наследственных заболеваний
4) полигенных наследственных заболеваний
- С помощью геномного редактирования можно
1) изменить Ph клетки
2) изменить последовательность генома клетки
3) приобрести устойчивость к новым мутациям
4) увеличить уровень IQ человека
- С помощью системы CRISPR-Сas9 нельзя
1) исправить анеуплоидию
2) исправить индел
3) исправить точечную мутацию
4) сделать нокаут гена
- Свойством фермента с нуклеазной активностью является
1) вставка нескольких нуклеотидов
2) замена одного нуклеотида на другой
3) создание двуцепочечного разрыва ДНК
4) создание одноцепочечного разрыва ДНК
- Система CRISPR-Cas9 основана на
1) ДНК бактериофагов
2) иммунной системе бактерий
3) особых ферментах человека
4) плазмидах архей
- Система CRISPR-Cas9 является защитной системой у
1) бактерий
2) вирусов
3) моллюсков
4) членистоногих
- Система CRISPR-Сas9 была
1) открыта в клетках человека
2) открыта у бактерий
3) разработана биологами-синтетиками
4) разработана биофизиками
- Системой CRISPR-Cas9 могут быть отредактированы
1) белки
2) жиры
3) низкомолекулярные вещества
4) последовательности ДНК
- Теоретически методом редактирования генома можно вылечить
1) ОРВИ
2) инфекционное отравление
3) муковисцидоз
4) солнечный удар
- У бактерий система CRISPR-Cas9 уничтожает вирус путем
1) лизирования ДНК вируса ферментами
2) растворения ДНК вируса в особой кислоте
3) упаковки вируса в особую белковую оболочку, откуда он не может выйти и умирает
4) фрагментации ДНК вируса
- Ферментом, сшивающим две цепи ДНК при разрыве, является
1) лигаза
2) метилтрансфераза
3) полимераза
4) эндонуклеаза